INSA estuda diversidade genética do novo coronavírus em Portugal
O Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) está a desenvolver o estudo da diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2, que causa a doença COVID-19, em Portugal, um projeto de âmbito nacional que conta com a colaboração de uma rede de cerca de 20 hospitais do Continente e das Regiões Autónomas da Madeira e dos Açores.
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Este trabalho de investigação pretende, numa primeira fase, sequenciar o genoma de cerca de 1000 coronavírus SARS-CoV-2.
Coordenado pelo investigador João Paulo Gomes do Departamento de Doenças Infeciosas do INSA, o “estudo da diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal” visa determinar os perfis mutacionais do SARS-CoV-2 para identificação e monitorização de cadeias de transmissão do novo coronavírus, bem como identificação de novas introduções do vírus em Portugal.
O trabalho do INSA, que vai ao encontro das orientações das autoridades de saúde e da comunidade científica internacional de efetuar estudos focados no genoma do novo coronavírus, permitirá também determinar o início da transmissão na comunidade e aferir sobre o impacto das medidas de contenção.
Outro dos objetivos da investigação passa por determinar possíveis associações entre perfis mutacionais do SARS-CoV-2 e diferentes graus severidade da doença (COVID-19).
O estudo possibilitará ainda determinar o grau de variabilidade genética de antigénios do SARS-CoV-2 (proteínas do vírus que induzem uma resposta do nosso sistema imunitário) com possível impacto no desenvolvimento de medidas profiláticas (vacinas) e determinar o grau de variabilidade genética de proteínas do coronavírus que são alvos de fármacos antivirais, com possível impacto no desenvolvimento de medidas terapêuticas.
No âmbito deste estudo, o qual foi submetido a pedido de financiamento à Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT) e à Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (AICIB), mas que se pretende que seja alargado a curto prazo mediante financiamento compatível, foi já criado um site em que estão disponíveis todos os resultados obtidos e que será atualizado à medida que existirem mais dados.
A nova plataforma estará também disponível através do portal Science4COVID-19, criado recentemente pela FCT e pela AICIB, em colaboração com o INSA.
Até à data, foram analisados cerca de 100 genomas de SARS-CoV-2 obtidos de amostras positivas colhidas em vários pontos do país. A sequência completa do genoma é identificada com recurso a tecnologias de sequenciação de nova geração e análise bioinformática através da plataforma online INSaFLU, sendo, posteriormente, a integração dos dados genómicos de Portugal na diversidade à escala global efetuada com recurso às ferramentas do projeto Nextstrain.
